兄弟俩相认的同时，也是地球军和ZAFT的战斗结束的时候，创世纪被阿斯兰正义高达的自爆而毁灭，基拉杀死了克鲁泽为芙蕾报了仇。参与这场战役的地球军也几乎全灭，双方以同样惨重的代价结束了这场战争。

　　在这之后还有一段漫长的搜救行动，之前还是拼得你死我活的战斗现在双方都派出了所有能出动的队伍展开了战后的维护工作，那些受伤的人或失去行动能力的机体现在终于有人理会了。

　　签署和平协议是之后的事，现在他们正感受着久别重逢的心情。

　　直到舰桥上的人到来之前，他们还时断时续地说着在这期间发生的一切。

　　“这么说，你们是姐弟了？”玛琉看着两个几乎一模一样的两人说道，此刻的她已经从失去穆的悲痛中缓过来。

　　“是的，我们原本住在奥布的一所孤儿院里，当然，那是十年前的事了。”阿尔如此说道，他看着身边的阿唯掩饰不住内心的喜悦。“后来因为一些事，我才辗转到了PLANT。”

　　“是吗。”玛琉笑道。“虽然发生了很多事，但你们还是再次见到对方了呢。”

　　“嗯，这还得多谢舰长收留了这丫头，我才能再一次见到她啊。”阿尔看了看，海洛姬丝，后者回给他一个鬼脸。

　　“她是一个很好的人，却是有一些苦命。”这话却是指阿唯。

　　“嗯，我打算战争结束之后带她去PLANT，那里的医生一定会治好她的。”一提起这事，阿尔一脸凝重。

　　大天使号曾经有准备有阿尔的卧室，直到现在依然没换其他人住。从玛琉那里告别之后，三人回到了阿唯的房间。

　　“我早已原谅你了，但不知道为什么，看到你这张脸，我却又想起那些不愉快的事情。”阿唯对阿尔这么说道。

　　阿尔讪讪而笑，尽管他们再一次见面，但却没有了曾经的默契，尽管还是那个人，心境却变了。

　　“你……还在生我的气吧？”

　　“少来了，我为什么非得气这么久？倒是你，这么久了还待在这里，别告诉我你想睡在这里啊。”阿唯开了句玩笑之后，拿起一瓶药剂一饮而尽。

　　“如果不是我，你也不会依靠这些活下去。”阿尔说着竟哭起来，他真的很后悔，这件事就算阿唯能原谅，他也始终带着愧疚。“都是我的错，当时如果我不那么做……”

　　“那么喝这瓶药的就是两个人了。”阿唯打断了他的话，“我没有你那么好的运气，之所以会有这样的结果也早就预定好了。主角并不全是好运的，也有像我这样的人。”

　　阿尔一抹眼泪，非常认真的说道：“我一定会补偿你的，我一定会治好你，让你永远摆脱药物的控制。”

　　“嗯。拉克丝答应帮助我了。”

　　“拉克丝？”阿尔一愣，克莱茵一派虽遭到萨拉一派的攻击元气大伤，但在民间依然有很高的支持率，现如今帕特里克身死，不出意外克莱茵派很快就又会掌握实权。但事实却已经证明，下一任议长是那只狐狸。因此当阿唯说出这番话时，阿尔是不相信的。

　　拉克丝第二部开始的时候是在地球，每天和基拉外加一群小屁孩过着与世无争的生活，怎么可能帮得了她？

　　念及此阿尔不由得说道：“还是先别把话说得这么满，我们不能把你的未来全押在拉克丝身上，在PLANT她被列为叛国者加以通缉，至少现在她是回不去的。我认识一些生物学方面的科学家，到时候如果拉克丝帮不了你的话，至少还有我可以。”

　　阿唯心一暖，点头算是同意他了。

　　次日，阿尔带着海洛姬丝依依不舍地返回威尔逊号。

　　见到队长终于回来的克莱西亚队终于再次找到了主心骨，多拉夫舰长早在前一日就收到了援救任务，但是那个时候队长早已失去联络很久了，队内上下都以为他已阵亡，没想到过了没多久就回来了，而且还带着之前同样被认为阵亡了的海洛姬丝·德普兰。

　　作为战争的幸存者，阿尔弗雷德接到命令出席和平签约仪式，而三舰联盟却悄声而退。除了参加过雅金·杜威攻防战的高层，她们被刻意地遗忘了。

　　这次战争致使蓝波斯菊理事穆尔塔·阿兹拉艾鲁身亡，一些被蓝波斯菊的支持者们推上战场的国家纷纷赞同协议的促成。最终双方在尤尼乌斯7的残骸上方签订了和平协议，在这种地方上和谈，颇有一种警惕战争危害的意味。当然也不排除一切由这里而起，由这里而终的意思。

　　合约签署完之后，双方领导人互相握手，至于这里面有多少真诚就不得而知了。

　　拉克丝·克莱茵因为盗取永恒号与自由号而被PLANT通缉，不得已和大天使号返回地球，永恒号与自由高达随着这场战役一同消失。

　　这之后不久有人把玖尔队通敌的事情抖出来，致使伊扎克·玖尔和迪亚哥·奥尔斯曼险些被革除ZAFT军籍蹲大狱，最后还是代理议长吉尔伯特·迪兰达尔的调解下将两人免去牢狱之灾。等到吉尔伯特正式当选PLANT议长之后，不但赦免了伊扎克和迪亚哥的行为，让他们仍然统帅一支队伍，还将原本帕特里克·萨拉议长宣布拉克丝为叛国者的罪名取消。这一举动不但让军层人感激不已，还让原本就同情克莱茵一派的人对这位年轻的PLANT领袖亦抱有尊敬，迪兰达尔的豁达和贤明使他一举成为最出色的PLANT议长。

　　两次雅金·杜维的惨烈战役使得ZAFT精英稀缺，后来加入的士兵们便将在这场战役中幸存下来的伊扎克·玖尔和阿尔弗雷德·克莱西亚视为ZAFT双壁，PLANT的军事议员们还提议为这两人开发新的机体以嘉奖他们在战争中做出的贡献。

　　这话要是放在之前，他们是不会有人敢这么说的，但正因为现任议长的贤明，才让原本是ZAFT和PLANT罪人的伊扎克再度指挥部队，才有人会有这个提议。

　　与此同时，ZAFT的主力机体也开始大量升级换装，在不违背和平协议的情况下开始制造一系列新型机体作为基本自卫力量。

　　阿尔为阿唯找到了生物学家来治疗她的药物依赖，说来也巧，这些生物学家是迪兰达尔的同门师兄弟，和克莱茵也关系匪浅。阿尔本人是在战争中获得了勋章的功臣，迪兰达尔自然对他另眼相看，对阿唯莉雅也极尽照顾。

　　随着时间流逝，阿唯莉雅的病情有明显好转，很显然这并不能难倒PLANT上的科学家。他们用另一种无害的药剂逐渐替换，最后在不断的试验中将新的药剂用量减少。

　　6个月之后，阿唯以完全康复。

　　这是个好的开始，在她康复出院之后，阿尔叫来了海洛姬丝等人，给她举办了一个庆祝会。

　　“恭喜终于摆脱自然人的药剂”是她听到的最多的话。

　　她拿出口袋里的糖块塞了一颗进嘴里，这就是逐渐替换原本药剂的东西，是特质的糖块，原本也含有微量强化人药剂成分的，但现下已完全无害，而且她喜欢上了这一零食。

　　“吃那么多糖，小心得糖尿病。”阿尔不和谐的声音在一边响起。

　　“咒术反弹。”阿唯回了他一句。